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案例分享 《在野豬和巴⻢豬的脂肪組織中進⾏三維基因組結構的重組》 Reorganizationof3DgenomearchitectureacrosswildboarandBamapigadiposetissues 期刊:Journal of Animal Science andBiotechnology|影響因⼦:6.175|發表時間:2022年|發表單位:四川農業⼤學 研究背景: 哺乳動物的基因組被組織成不同的層次,這些層次與基因表達的變化密切相關,甚⾄可能有因果關系 。近年來的研究對豬不同組織和細胞類型的染⾊質組織進⾏了表征,并⽐較了不同物種和豬早期發育過程中的染⾊質組織 。然⽽,⼈們對不同品種豬的染⾊質組織如何不同知之甚少。 研究思路:
研究結果: 在本研究中,對野豬和巴⻢豬的兩個脂肪庫(背部脂肪上層的ULB和⼤⽹膜)進⾏了三維基因組組織分析,并進⾏了轉錄組鑒定。研究發現野豬和巴⻢豬之間超過95%的A/B隔室和拓撲關聯域(TADs)是穩定的。相反,超過70%的啟動⼦增強⼦的相互作⽤是動態的和⼴泛存在的,涉及超過1000個基因。染⾊質結構的改變與基因表達的變化有關,這些基因參與了⼴泛的⽣物學功能,如基本的細胞功能、內分 泌功能、能量代謝和免疫反應。在兩個豬品種中,與重組的A/B隔室和PEIs相關的基因在GOM和ULB之間分別有⼤約95%和97%的差異。
圖:野豬和巴⻢豬Hi-C分析 |



