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樣本處理及建庫系統 / 二代測序系統
二代測序系統

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武漢愛基百客生物科技有限公司（簡稱愛基百客），位于武漢高農生物園，辦公面積逾3000平方米，是一家專注于表觀組學、單細胞時空組學和高通量測序分析服務的新型生物科技企業。

公司旨在為客戶提供專業的科研服務，運營至今合作的科研客戶近千家，涵蓋國內知名科研院所、高校以及相關生物企業，運營至今銷售額超1億元，科研成果曾多次在Science、Cancer Cell、Plant Cell、Nature Communications、J HEMATOL ONCOL等國際高水平學術期刊發表，受到了客戶廣泛好評，是國內成長最迅速的多組學科研服務企業之一。

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網站首頁 >> 科技服務 >>核酸的甲基化修飾 >>DNA甲基化 >> 靶向甲基化測序（TBS）

详细说明

靶向甲基化測序（TBS）

產品介紹
案例分享

TBS（Target Bisulfite sequencing）

產品介紹：

TBS是將傳統的BSP（bisulfite sequencing PCR）與高通量測序技術結合起來。其原理為用重亞硫酸鹽處理基因組DNA，所有未發生甲基化的胞嘧啶（C）被轉化為尿嘧啶（U）而甲基化的胞嘧啶則不變。通過設計BSP引物擴增目的片段，此時尿嘧啶（U）全部轉化為胸腺嘧啶（T），最后連接⼆代測序接頭進⾏高通量測序，利用數據分析就能判斷CpG位點是否發生甲基化。TBS技術可滿足幾個到幾百個基因或位點的驗證需求，具有高準確率、⾼通量、低成本、周期短等優勢。

技術路線：

樣本要求：

細胞：≥5×10⁶個

動物：≥10mg

基因組DNA：≥3μg

DNA濃度：≥50ng/μl

建庫測序：

測序策略：NovaSeq6000

測序深度：≥200X

項目周期：

35個⼯作⽇

案例分享

【項⽬⽂章】HOXD1抑制肺腺癌進展，并受DNA甲基化調控

HOXD1 inhibits lung adenocarcinoma progression and is regulated by DNA methylation

期刊：Oncology Reports｜影響因⼦：3.8｜發表時間：2024年｜發表單位：⼭東第⼀醫科⼤學

研究背景：

非小細胞肺癌（NSCLC）是肺癌中最常見的類型，占所有肺癌病理類型的80%～85%。盡管在NSCLC的早期檢測策略和治療方面取得了一定的進展，但識別新的生物標志物對于指導NSCLC的預后仍然非常重要。在肺癌研究中，HOXD基因的異常表達與肺腺癌（LUAD）的發生和進展有關，但關于HOXD1在肺癌中的作用尚不清楚。

研究結果：

體外研究表明HOXD1過表達抑制了LUAD細胞的增殖、遷移和侵襲。在小鼠腫瘤模型中，HOXD1的上調被證明可以抑制腫瘤生長。進一步地，研究者通過靶向亞硫酸鹽測序TBS和染色質免疫沉淀ChIP實驗，發現HOXD1基因啟動子區域發生了DNA超甲基化，并與DNA甲基轉移酶（DNMTs）的作用相關。此外，上調的HOXD1作為轉錄因子，ChIP-seq實驗及RT-PCR結果顯示HOXD1增加了骨形態發生蛋白BMP2和BMP6的轉錄表達。