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樣本處理及建庫系統 / 二代測序系統
二代測序系統

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武漢愛基百客生物科技有限公司（簡稱愛基百客），位于武漢高農生物園，辦公面積逾3000平方米，是一家專注于表觀組學、單細胞時空組學和高通量測序分析服務的新型生物科技企業。

公司旨在為客戶提供專業的科研服務，運營至今合作的科研客戶近千家，涵蓋國內知名科研院所、高校以及相關生物企業，運營至今銷售額超1億元，科研成果曾多次在Science、Cancer Cell、Plant Cell、Nature Communications、J HEMATOL ONCOL等國際高水平學術期刊發表，受到了客戶廣泛好評，是國內成長最迅速的多組學科研服務企業之一。

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網站首頁 >> 科技服務 >>轉錄調控相關研究 >> LncRNA-seq

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LncRNA-seq

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LncRNA-seq

產品介紹：

長鏈非編碼 RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是長度⼤于200個核苷酸的非編碼RNA。研究表明,lncRNA在表觀遺傳調控、細胞周期調控和細胞分化調控等眾多⽣命活動中發揮重要作用。它主要是利用高通量測序技術進⾏lncRNA 測序，并結合⽣物信息學的預測工具進⾏lncRNA 分析，分析lncRNA與特定生物學過程的關系。該方法可以更加高效地獲取lncRNA 序列以及位置信息，且突破了常規lncRNA芯片檢測技術的使用范圍限制，還可對新的lncRNA 進行預測及功能分析，極大促進lncRNA的深入研究。

技術流程：

樣本要求：

細胞：≥1×10⁶個

動物組織：≥1 g

植物組織：≥5 g

真核微生物：300mg/10⁶

建庫測序：

測序策略：NovaSeq6000，PE150

測序深度：12-20 G

項目周期：

45個工作日

案例分享

《LncRNAFIRRE通過與PTBP1相互作用，作為腫瘤啟動子穩定BECN1mRNA，促進自噬》

LncRNAFIRREfunctionsasatumorpromoterbyinteractionwithPTBP1tostabilizeBECN1mRNAandfacilitateautophagy

期刊：CellDeath&Disease｜影響因⼦：9.685｜發表時間：2022年｜發表單位：復旦⼤學

研究背景：

⻓鏈⾮編碼RNA（lncRNAs）在各種癌癥中起著關鍵作⽤。Firre基因間重復 RNA 元件（FIRRE）是⼀個位于細胞核內的lncRNA，在結腸直腸癌（CRC）中過表達。然⽽，FIRRE在結直腸癌中的具體機制尚不明確。

研究結果：

通過HE染⾊區分癌變組織和正常組織。通過⾼通量測序（LncRNA-seq)來評估腫瘤和鄰近正常組織配對組織中 lncRNA 表達的差異情況。火山圖揭示了整體的基因表達水平。其中，FIRRE在腫瘤組織中過表達。CRC細胞系的qPCR結果顯⽰，FIRRE在癌細胞中過表達。然后，作者利⽤ RNA pull-down、RIP、細胞周期測定等⼀系列實驗發現FIRRE在結直腸癌中作為⼀種致癌因⼦，通過穩定BECN1 mRNA誘導腫瘤的發展,以及以 PTBP-1介導的⽅式促進⾃噬。