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樣本處理及建庫系統 / 二代測序系統
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武漢愛基百客生物科技有限公司（簡稱愛基百客），位于武漢高農生物園，辦公面積逾3000平方米，是一家專注于表觀組學、單細胞時空組學和高通量測序分析服務的新型生物科技企業。

公司旨在為客戶提供專業的科研服務，運營至今合作的科研客戶近千家，涵蓋國內知名科研院所、高校以及相關生物企業，運營至今銷售額超1億元，科研成果曾多次在Science、Cancer Cell、Plant Cell、Nature Communications、J HEMATOL ONCOL等國際高水平學術期刊發表，受到了客戶廣泛好評，是國內成長最迅速的多組學科研服務企業之一。

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網站首頁 >> 科技服務 >>轉錄調控相關研究 >> Small RNA-seq

详细说明

Small RNA-seq

產品介紹
案例分享

Small RNA-seq

產品介紹：

smallRNA是生物體內⼀類重要的功能分子，廣泛存在于高等和低等生物體內。SmallRNA與細胞的發育、分化、疾病等密切相關。近年來的研究表明，smallRNA不僅可作為癌癥診斷、識別、預后的標志物，也在癌癥治療中發揮作用。

smallRNA包括microRNA、siRNA、snoRNA、piRNA等。它們的主要功能是誘導基因沉默，調控細胞生長、發育、基因轉錄和翻譯等生物學過程。通過mRNA降解、翻譯抑制、異染色體形成以及DNA去除等多種途徑，廣泛的參與調控⽣物體的生長發育和疾病發生。基于新⼀代⾼通量測序技術的smallRNA 測序，可⼀次性獲得數百萬條small RNA 序列，能夠快速地鑒定某種組織在特定狀態下的所有已知smallRNA并發現新的smallRNA，以及預測smallRNA靶基因，為smallRNA功能研究和調控機制提供有力的工具。

分析流程：

miRNA分析流程.png

樣本要求：

細胞：≥1×10⁶個

動物組織：≥3 g

植物組織：≥1g

真核微生物：≥300mg/10⁶

建庫測序：

測序策略：SE50

測序量：10-20 M

適用范圍：有參考基因組物種

項目周期：

45個工作日

案例分享

【項⽬⽂章】《通過轉錄組、miRNA組及降解組聯合分析探究桂花開放與衰老的miRNA-靶基因調控模塊》

Exploring miRNA-target modules regulating flower opening and senescence in Osmanthus fragrans through integrated transcriptome, miRNAome, and degradome analysis

期刊：Industrial Crops & Products｜影響因⼦：6.2｜發表時間：2025年｜發表單位：湖北科技學院

研究背景：

桂花是中國十大傳統名花之一，廣泛應用于觀賞、食品和化妝品行業。花朵開放和衰老過程對其生命周期至關重要，但其最佳商業采收期僅持續 2-3 天，這成為了產業發展的重大瓶頸。MicroRNA (miRNA) 是調節植物生長、發育和脅迫反應的關鍵非編碼小 RNA (sRNA)。然而，關于miRNA與mRNA之間的調控網絡，特別是在桂花花朵開放和衰老過程中的作用，目前仍知之甚少。

研究結果：

該研究通過Small RNA-seq 測序鑒定了135個miRNA，包括46個已知miRNA和89個新miRNA，其中73個表現出差異表達。此外，利用降解組測序鑒定了112個miRNA的529個靶基因，其中57個靶基因被歸類為0-2類。在這些靶基因中，有26個是轉錄因子，包括12個SBP、5個NAC、3個ARF、2個AP2和2個GRF。針對所有這些靶基因對構建了一個調控網絡。通過該網絡以及對差異表達基因(DEG)的加權基因共表達網絡分析(WGCNA)，研究鑒定了調節花朵開放 (ofr-miR156j-OfSPL2/SPL9和ofr-miR396a-5p-OfGRF1) 和花朵衰老 (ofr-miR164b-5p-OfNAC079和ofr-miR394b-5p-OfFBXO6) 的關鍵miRNA-mRNA模塊。這些模塊通過生物信息學分析和qRT-PCR 檢測得到了進一步驗證。該研究首次系統鑒定了參與桂花花朵開放和衰老的miRNA，建立了一個全面的調控網絡，為未來深入研究miRNA介導的這些過程的調控機制奠定了基礎。