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全基因組甲基化測序
全基因組甲基化測序（Whole Genome Bisulfite Sequencing） 產品介紹： 全基因組甲基化測序(WGBS)是利⽤重亞硫酸氫鹽對全基因組DNA進⾏處理，使未甲基化修飾的胞嘧啶堿基轉化為尿嘧啶堿基，然后在后續PCR過程中，尿嘧啶堿基轉化成胸腺嘧啶堿基。利⽤⾼通量測序在全基因組范圍內檢測所有的甲基化位點，繪制單堿基分辨率的DNA甲基化圖譜 。WGBS能為基因組時空特異性修飾的研究提供重要的技術⽀持，⼴泛應⽤于個體發育、衰⽼和疾病過程中表觀遺傳差異的作⽤機理研究中，也是各物種甲基化圖譜研究的⾸選技術。
分析流程：
技術優勢：
樣本要求： 細胞：≥5×106個 動物組織：≥0.2g 植物組織：≥3g 建庫測序： 測序策略：Illumina， PE150 測序深度：≥30× 項目周期： 45個工作日 案例分析 【項⽬⽂章】《DNA低甲基化通過⽣⻓素和⼄烯響應途徑介導桂花中花的開放和衰⽼》 DNAhypomethylationmediatesfloweropeningandsenescenceinsweetosmanthusthroughauxinandethyleneresponsivepathways 期刊：PostharvestBiologyandTechnology｜影響因⼦：6.751｜發表時間：2023年｜發表單位：湖北科技學院 研究背景： 桂花是中國最受歡迎的⼗⼤傳統花卉之⼀，被⼴泛⽤于觀賞、⻝品/化妝品添加劑等。但其花期 普遍較短，最佳商業采收期僅為2-3d，極⼤地限制了其觀賞價值和經濟可⾏性。內源性⼄烯的產⽣是花衰⽼的重要調節因⼦。⼄烯增強了DNA碎⽚，破壞亞細胞結構，導致花瓣脫落。然⽽，桂花內源⼄烯產⽣的機制和花從開放到衰⽼的過程尚不清楚 。已有研究表明，DNA甲基化參與調控果實成熟和葉⽚衰⽼（如番茄、擬南芥等）。然⽽，DNA甲基化在調控桂花開花和衰⽼中的作⽤尚不清楚。 技術路線：
研究結果： 本研究通過對桂花全基因組DNA甲基化和轉錄組譜的綜合分析，揭示了DNA去甲基化在桂花開花過程中起著重要作⽤ 。DNA低甲基化可能通過⽣⻓素反應途徑OfSAUR基因介導花開放，并通過⼄烯合成和反應途徑OfERF基因介導花衰⽼。最終，作者提出了⼀種表觀遺傳調控三組分模型，在該模型中，花的開放和衰⽼由DNA去甲基化調控，通過介導特定基因家族的表達，以及植物激素⽣⻓素和⼄烯，將花轉變為開放和衰⽼的狀態。
圖：DNA低甲基化通過⽣⻓素和⼄烯反應途徑介導花的開放和衰⽼ |
